232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1201 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  100 
 
 
92 aa  183  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  54.17 
 
 
85 aa  81.3  0.000000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  41.67 
 
 
74 aa  69.7  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  41.43 
 
 
75 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  41.1 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  45.07 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  45.21 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  47.22 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  44 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  43.06 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  43.66 
 
 
76 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  44.93 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  40.54 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  43.48 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  40 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  38.57 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.03 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  52.63 
 
 
102 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  45.83 
 
 
75 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  45.83 
 
 
101 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.58 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.58 
 
 
75 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  42.86 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  42.86 
 
 
76 aa  61.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  43.59 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  42.19 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  40.85 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  42.62 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  40.85 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  40.85 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  39.71 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  41.89 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  38.57 
 
 
213 aa  58.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  35.21 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  42.42 
 
 
74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  40.85 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  40.85 
 
 
82 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  42.25 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  40.85 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  42.86 
 
 
87 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  35.21 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  37.14 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  40 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  40.85 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  40.85 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  39.13 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  45.59 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  37.68 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  40.28 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  46.3 
 
 
90 aa  54.7  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  42.31 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  37.68 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  37.14 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.44 
 
 
201 aa  54.3  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  36.84 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  42.65 
 
 
81 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  40.35 
 
 
75 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  49.06 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  40 
 
 
78 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  35.21 
 
 
77 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
80 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  39.39 
 
 
78 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  36.84 
 
 
101 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  37.5 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  41.03 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  36.11 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  34.33 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.62 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  38.71 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  38.03 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  41.67 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  41.1 
 
 
93 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  39.44 
 
 
85 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  40.28 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  36.62 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  40.91 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  38.81 
 
 
77 aa  51.6  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  45.31 
 
 
83 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  37.14 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>