174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0108 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  96.1 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  96.1 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  96.1 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  96.1 
 
 		 77 aa  154  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  90.41 
 
 		 79 aa  141  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  89.04 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  89.04 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  89.04 
 
 		 89 aa  138  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  83.12 
 
 		 77 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  81.82 
 
 		 77 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  81.82 
 
 		 77 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  71.23 
 
 		 78 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  68.57 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  68.57 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  67.14 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  58.44 
 
 		 78 aa  105  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  58.9 
 
 		 81 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  61.43 
 
 		 75 aa  103  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  50.7 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  50.7 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  49.3 
 
 		 88 aa  83.6  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  48.57 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  48.57 
 
 		 79 aa  63.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  42.86 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  45.21 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  34.67 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  43.64 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  38.36 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.07 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  47.83 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.29 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  35.29 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  36.23 
 
 		 94 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  43.55 
 
 		 75 aa  50.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  36.23 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  38.03 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  32.89 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  33.82 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  36.23 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.82 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.82 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  29.87 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  33.82 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.27 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  32.35 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  37.68 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 81 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  36.11 
 
 		 77 aa  47  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  40.98 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  37.29 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  30.88 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  30.14 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  33.78 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  34.78 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  36.76 
 
 		 181 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  36.99 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  29.58 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  30.99 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  29.58 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  37.14 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  28.57 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  31.43 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  35.94 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  37.68 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  32.76 
 
 		 78 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  28.57 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  28.57 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>