258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0904 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  100 
 
 
78 aa  163  6.9999999999999995e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  84 
 
 
85 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  63.77 
 
 
78 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  59.42 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  57.14 
 
 
74 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  56.52 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  56.52 
 
 
90 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  55.41 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  54.05 
 
 
94 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  51.35 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.76 
 
 
102 aa  67.4  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  46.27 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  46.27 
 
 
101 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  46.27 
 
 
78 aa  67  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  50 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  50.75 
 
 
89 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  51.47 
 
 
100 aa  65.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  44.78 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  46.27 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  41.18 
 
 
75 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  42.42 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  43.28 
 
 
74 aa  63.5  0.0000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  50 
 
 
80 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  49.25 
 
 
87 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  40.3 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  44.93 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  46.27 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.71 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  39.47 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  41.79 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  43.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  43.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  47.83 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  43.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  38.24 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  43.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  48.53 
 
 
81 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  42.65 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  43.28 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.74 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  42.86 
 
 
84 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  41.79 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.71 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  50 
 
 
89 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
79 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  46.38 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  44.78 
 
 
81 aa  58.2  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32.47 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  33.77 
 
 
186 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  32.47 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  32.47 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.78 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  41.43 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  44.16 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  43.66 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  39.71 
 
 
78 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  44.78 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  41.79 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  42.86 
 
 
85 aa  57.4  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  46.27 
 
 
91 aa  57.4  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38.46 
 
 
77 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  46.27 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  47.76 
 
 
80 aa  57  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
80 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  47.17 
 
 
74 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  37.68 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  41.79 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  43.48 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  39.71 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  31.17 
 
 
194 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  38.81 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.78 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  45.31 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  38.57 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  43.66 
 
 
101 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  44.12 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  31.17 
 
 
186 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  36.99 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  40.3 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>