292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0831 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  100 
 
 		 93 aa  178  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  91.76 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  89.41 
 
 		 88 aa  145  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  68.06 
 
 		 89 aa  89  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  56.98 
 
 		 89 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  59.72 
 
 		 91 aa  88.2  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  56 
 
 		 97 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  57.33 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  55.41 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  59.46 
 
 		 100 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  50 
 
 		 85 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  55.56 
 
 		 80 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  61.43 
 
 		 87 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  58.82 
 
 		 80 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  72.73 
 
 		 82 aa  78.6  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  52.94 
 
 		 71 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  58.44 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  49.32 
 
 		 82 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  54.55 
 
 		 90 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  46.43 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  44.74 
 
 		 78 aa  70.9  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  46.48 
 
 		 74 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  50 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  47.14 
 
 		 74 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  47.89 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  45.83 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  50 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  36.84 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  40.79 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  42.03 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  42.86 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  45.59 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  43.06 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  42.86 
 
 		 76 aa  55.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.79 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  36.71 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.44 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  39.19 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  50.72 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.03 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  45.33 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.13 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  42.86 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  44.93 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  42.86 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  35.9 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  37.68 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  35.9 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  34.78 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  32.89 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  37.14 
 
 		 103 aa  51.6  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  40 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  38.57 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  39.73 
 
 		 213 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  35.71 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  29.41 
 
 		 186 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  39.29 
 
 		 82 aa  50.8  0.000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  40.58 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  34.21 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  35.29 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  32.86 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  37.68 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.68 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  47.17 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  39.13 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  37.68 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  38.46 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  30.26 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  40.58 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  32.86 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  36.23 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  39.13 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  29.89 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  39.13 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  35.62 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.58 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>