200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2705 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  100 
 
 		 81 aa  159  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  43.42 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  56.6 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  45.07 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  41.89 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  43.21 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.78 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  38.57 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  42.03 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.08 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  43.55 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  43.55 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  38.57 
 
 		 101 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  36.23 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.62 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  37.14 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  42.86 
 
 		 93 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  50.94 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  48.98 
 
 		 74 aa  52.4  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  50.94 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  41.43 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  32.39 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  38.36 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  37.5 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  38.36 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  34.72 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  36.76 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  35.21 
 
 		 74 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  32 
 
 		 79 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  35 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  41.43 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  36.62 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  34.25 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  34.25 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  37.14 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32.39 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  47.17 
 
 		 102 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  38.89 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  37.29 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  37.29 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  41.79 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  35.21 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.66 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.66 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  32.88 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  31.08 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.66 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  37.14 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  28.75 
 
 		 201 aa  46.2  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  32.88 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  34.72 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.21 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  32.84 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  35.71 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.21 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  33.8 
 
 		 77 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.21 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  29.73 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.21 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.21 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  44.9 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6347  hypothetical protein  34.85 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341476  normal  0.150375 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38.6 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  35.59 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  38.6 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  32.39 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2418  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.753437  hitchhiker  0.000838905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  30.14 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  35.59 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  30.38 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  30.38 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  38.71 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  38.6 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  30 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  39.22 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1201  SirA family protein  37.14 
 
 		 92 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2086  SirA family protein  32.39 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  36.36 
 
 		 200 aa  44.3  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  28.38 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  32.43 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  32.5 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  33.78 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  42.11 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>