More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0054 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  90.7 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  60.87 
 
 		 97 aa  117  6e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  50.6 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  51.28 
 
 		 81 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  56.16 
 
 		 78 aa  87.4  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  53.85 
 
 		 81 aa  87  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  51.25 
 
 		 81 aa  86.3  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  51.32 
 
 		 81 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  51.25 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  51.39 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  51.39 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  51.39 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  48.68 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  43.53 
 
 		 84 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  48.61 
 
 		 83 aa  83.6  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  51.39 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  49.32 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  47.62 
 
 		 83 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  49.35 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  52.63 
 
 		 81 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  52.78 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  49.32 
 
 		 81 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  51.32 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  51.32 
 
 		 81 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  48.68 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  51.28 
 
 		 81 aa  80.9  0.000000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  49.4 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  45.45 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  46.43 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  45 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  47.37 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  52.86 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  48.72 
 
 		 83 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  45.57 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  47.37 
 
 		 99 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 82 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  47.95 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  47.14 
 
 		 82 aa  74.7  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  45.33 
 
 		 83 aa  75.1  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  45.45 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  44.44 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.06 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  42.62 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.96 
 
 		 80 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  40 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  38.89 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  38.03 
 
 		 79 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  37.66 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  37.66 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.14 
 
 		 831 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  32.89 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  31.08 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  32 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  35.62 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  33.77 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  30.26 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.33 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  35.14 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  31.58 
 
 		 76 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  46.43 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  36.11 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  39.44 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  36.71 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  35.71 
 
 		 85 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  28.95 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  29.33 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  28.95 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>