More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2932 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  100 
 
 
77 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50 
 
 
189 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  50 
 
 
189 aa  84  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  45.33 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  49.33 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  42.47 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  41.1 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  44.12 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  47.37 
 
 
80 aa  77.8  0.00000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  36.84 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  41.89 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  41.56 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  41.56 
 
 
186 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  41.56 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  41.89 
 
 
76 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  45.33 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  45.33 
 
 
80 aa  73.9  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  40.26 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  40.26 
 
 
186 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  40.54 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  40.54 
 
 
75 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  43.48 
 
 
72 aa  72  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36.36 
 
 
194 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  42.86 
 
 
81 aa  72.4  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.89 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  40.26 
 
 
77 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  44.12 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  40.26 
 
 
186 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  48.05 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  47.37 
 
 
81 aa  70.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  47.83 
 
 
77 aa  70.9  0.000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  38.16 
 
 
77 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  42.65 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.43 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  38.16 
 
 
77 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  48.65 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  41.56 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  42.03 
 
 
83 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  42.65 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  38.03 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  39.44 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  42.03 
 
 
83 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  41.18 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.36 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  40.26 
 
 
81 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  42.65 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  39.47 
 
 
79 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  39.47 
 
 
79 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  44.12 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  43.48 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  42.65 
 
 
80 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  42.65 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  42.67 
 
 
80 aa  65.5  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  43.06 
 
 
85 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  39.71 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  39.71 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  42.03 
 
 
79 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  43.48 
 
 
79 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  39.47 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  40.58 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  39.13 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  42.65 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  37.33 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.24 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  40.28 
 
 
92 aa  64.3  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  36.62 
 
 
83 aa  64.3  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  36.76 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  44.44 
 
 
82 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40.28 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  40 
 
 
75 aa  63.9  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  37.68 
 
 
82 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  41.18 
 
 
83 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  39.13 
 
 
81 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  44 
 
 
81 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>