285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3436 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  100 
 
 
81 aa  167  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  62.2 
 
 
81 aa  103  7e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  61.04 
 
 
78 aa  99.8  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  60.27 
 
 
75 aa  95.5  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  47.89 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  47.89 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  47.89 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  47.89 
 
 
76 aa  74.7  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  43.06 
 
 
79 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  32.91 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  32.91 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  42.47 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  37.84 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.96 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  36 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.71 
 
 
77 aa  65.1  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  38.24 
 
 
77 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.85 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  34.67 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  33.77 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.14 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  44.62 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  33.78 
 
 
189 aa  61.2  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  37.04 
 
 
76 aa  61.2  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  32.35 
 
 
72 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  33.82 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  35.53 
 
 
76 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  39.44 
 
 
81 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  34.29 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  31.65 
 
 
81 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  34.29 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  39.13 
 
 
78 aa  58.9  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  31.08 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  33.78 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  33.8 
 
 
76 aa  58.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.43 
 
 
189 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  31.65 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  31.65 
 
 
84 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  31.65 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  32 
 
 
85 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  34.67 
 
 
186 aa  57.4  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  36.11 
 
 
75 aa  57.8  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  36.23 
 
 
82 aa  57.4  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  30 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  30.67 
 
 
103 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.08 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.38 
 
 
78 aa  57  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  32.43 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  31.17 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  30.56 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  34.67 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  32.43 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  29.73 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  29.73 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  28.77 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  29.33 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  29.73 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  34.67 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  29.73 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  29.73 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  34.78 
 
 
938 aa  55.8  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  33.8 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  29.73 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  31.08 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  32.47 
 
 
79 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  30.67 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  35.21 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  30.43 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  33.82 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  29.73 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  34.62 
 
 
200 aa  55.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  32 
 
 
186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  30.14 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  34.33 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  29.73 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  36 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  30.14 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  32 
 
 
186 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  29.33 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  42.03 
 
 
115 aa  55.1  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  32.86 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>