196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0567 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  100 
 
 
75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  60.81 
 
 
75 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  58.11 
 
 
75 aa  96.7  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  49.28 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  45.95 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  47.3 
 
 
75 aa  80.5  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  45.95 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  45.95 
 
 
75 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  45.95 
 
 
76 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  44.59 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  44.59 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  44.59 
 
 
75 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  44.59 
 
 
76 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  44.59 
 
 
76 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  43.24 
 
 
75 aa  75.5  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  46.38 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  38.67 
 
 
75 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  32.39 
 
 
78 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.44 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.13 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  45.71 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  41.18 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.36 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 
83 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  65.1  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  36.11 
 
 
78 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  34.72 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  64.3  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  34.78 
 
 
77 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  39.71 
 
 
194 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  36.49 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  39.71 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.67 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.36 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  36.23 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  38.24 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  38.24 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  38.24 
 
 
186 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  36.99 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  33.33 
 
 
75 aa  62  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  31.88 
 
 
83 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.72 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  36.76 
 
 
186 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  34.72 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  33.82 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  35.71 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  32 
 
 
75 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  32 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  32 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  33.8 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.8 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  34.67 
 
 
78 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  36 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  33.33 
 
 
74 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  32.35 
 
 
79 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  37.14 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  29.41 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  35.14 
 
 
81 aa  57.4  0.00000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  35.71 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  35.71 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  30.88 
 
 
83 aa  57  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  29.73 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  34.21 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  32 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  35.21 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  33.33 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  33.33 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  33.33 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  34.67 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  31.34 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  27.94 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  38.03 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  55.5  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  32.39 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  30.67 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  36.62 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  32.39 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  38.67 
 
 
84 aa  55.1  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  32 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  31.51 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>