284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4280 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  100 
 
 		 83 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  70.51 
 
 		 81 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  67.95 
 
 		 81 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  69.23 
 
 		 81 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  66.25 
 
 		 99 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  72 
 
 		 81 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  114  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  68 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  68 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  66.67 
 
 		 81 aa  113  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  64.94 
 
 		 86 aa  113  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  8.999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  65.33 
 
 		 81 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  68 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  64.1 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  65.38 
 
 		 81 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  64.1 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  64.1 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  64.1 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  64.1 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  64.1 
 
 		 111 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  61.73 
 
 		 81 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  60.26 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  62.82 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  60.26 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  60.26 
 
 		 84 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  69.44 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  65.82 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  61.54 
 
 		 81 aa  107  5e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  68.06 
 
 		 82 aa  107  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  61.64 
 
 		 78 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  58.97 
 
 		 81 aa  106  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  65.28 
 
 		 82 aa  104  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  57.69 
 
 		 80 aa  102  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  56.41 
 
 		 81 aa  100  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  56.76 
 
 		 79 aa  99  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  46.91 
 
 		 82 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  47.62 
 
 		 86 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  49.3 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  48.68 
 
 		 86 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  47.22 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  48.68 
 
 		 77 aa  78.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 80 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  42.35 
 
 		 97 aa  77.8  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  51.47 
 
 		 80 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  46.05 
 
 		 81 aa  77.4  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 79 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  48.53 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  49.32 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  50 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  38.03 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  37.68 
 
 		 79 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  37.68 
 
 		 83 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  31.94 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  33.8 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  34.78 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  34.78 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  39.44 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  33.8 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  33.33 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  34.72 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  31.94 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  32.39 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  33.33 
 
 		 79 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  32.88 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.23 
 
 		 817 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  35 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  39.73 
 
 		 78 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  33.8 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  31.94 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  29.41 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  33.33 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  38.24 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  39.62 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  32.39 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  38.81 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  31.88 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  33.82 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  38.36 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  30.67 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.5 
 
 		 831 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>