More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2653 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  100 
 
 		 78 aa  157  6e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  61.97 
 
 		 77 aa  90.5  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  52.94 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  50 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  49.23 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  42.03 
 
 		 77 aa  73.6  0.0000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  47.69 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  40.58 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  45.16 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  48.39 
 
 		 110 aa  67  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  44.62 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.28 
 
 		 813 aa  66.6  0.00000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  41.94 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.32 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  42.37 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  45.31 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.32 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  45.31 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  52.83 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  44.26 
 
 		 80 aa  65.5  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  43.75 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  33.8 
 
 		 78 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  42.19 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.37 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  39.71 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  35.82 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  39.34 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  41.79 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  41.79 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  36.23 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.68 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.36 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  38.98 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  41.38 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  33.87 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  42.37 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  44.23 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  36.92 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  34.85 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  34.85 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  34.85 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  34.85 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  34.85 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  41.38 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  37.93 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  45.71 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.34 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.34 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.67 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  33.87 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  40.32 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  38.46 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  39.06 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  42.86 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  41.27 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  42.86 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  30.56 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.66 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  39.68 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  38.1 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  32.84 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  41.27 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  45.31 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  37.29 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  37.88 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  37.66 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  35.59 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  37.5 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.32 
 
 		 831 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  33.33 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  36.21 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  40.35 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  41.56 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  42.86 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  30.99 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  36.07 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 356 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  36.11 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  32.35 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  44.83 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  42.86 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  34.85 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>