264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0353 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  100 
 
 		 77 aa  157  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  40.58 
 
 		 78 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  41.79 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  31.82 
 
 		 354 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  38.03 
 
 		 78 aa  57.4  0.00000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  29.85 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  42.37 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  40 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.82 
 
 		 817 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.43 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  36 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  34.78 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  38.18 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  40.74 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1155  regulatory protein, MarR  40.74 
 
 		 82 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  37.74 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  37.7 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  37.7 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  37.7 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  37.7 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  34.78 
 
 		 80 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  38.89 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  32.84 
 
 		 78 aa  53.5  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  36.07 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  35.09 
 
 		 938 aa  52.8  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.38 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  36.07 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  36.21 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  37.88 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  37.29 
 
 		 75 aa  52  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.82 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  28.12 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.94 
 
 		 813 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.99 
 
 		 817 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  36.07 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  34.43 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  34.43 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  28.12 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  34.55 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  37.04 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3548  SirA family protein  31.34 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.379024  normal  0.567232 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.07 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0140  SirA family protein  40.74 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  38.33 
 
 		 74 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  35.48 
 
 		 85 aa  50.8  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  30.51 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  32.79 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  32.73 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  33.93 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  33.9 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  37.04 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  35.85 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  35.85 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  35.48 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  35.85 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  33.96 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  38.33 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  50.4  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  36.07 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  28.12 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  34.55 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  28.12 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  35.85 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  28.12 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  33.96 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  32.73 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  28.12 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  28.12 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  33.9 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  28.77 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  33.9 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  31.48 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  37.04 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  32.76 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  31.67 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.19 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  38.18 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  28.81 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  31.75 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.9 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.36 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  32.2 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  29.31 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  32.79 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  31.58 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  33.96 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  41.51 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  32.31 
 
 		 354 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>