More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1218 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  100 
 
 		 77 aa  154  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  61.97 
 
 		 78 aa  90.5  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  42.86 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  41.43 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  41.1 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.73 
 
 		 78 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.28 
 
 		 837 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  41.18 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.1 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.24 
 
 		 77 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.73 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  40.28 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  47.46 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  34.25 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  41.33 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  39.73 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  32.89 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.03 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  39.73 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  41.79 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  35.62 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  35.62 
 
 		 78 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  37.31 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  40.91 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  40 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  44.29 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  41.27 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  35.29 
 
 		 194 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  39.68 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  37.5 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  41.27 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.13 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.13 
 
 		 80 aa  59.7  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.82 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  38.81 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  42.67 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  42.67 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.81 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.31 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  42.65 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  44.12 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  38.81 
 
 		 80 aa  59.3  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  38.33 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  38.33 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.68 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  46.67 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.68 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.59 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  38.33 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  45.45 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  31.34 
 
 		 78 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  41.18 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  40.91 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  35.82 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 356 aa  58.2  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.68 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  38.67 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  32.35 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  44.64 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  37.7 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40.68 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  40 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  38.57 
 
 		 80 aa  57  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  30.43 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  36.67 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  33.78 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  38.36 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.81 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.32 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  40.35 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  41.82 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  37.31 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  43.1 
 
 		 80 aa  56.6  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  36.99 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  32.88 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  40.3 
 
 		 92 aa  55.5  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.71 
 
 		 834 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  35.94 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  35.38 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  40 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>