More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_0734 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  97.37 
 
 
75 aa  149  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  97.37 
 
 
75 aa  149  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  97.37 
 
 
75 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  97.37 
 
 
75 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  97.37 
 
 
75 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  96.05 
 
 
75 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  96.05 
 
 
75 aa  146  9e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  91.89 
 
 
78 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  89.19 
 
 
77 aa  135  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  89.19 
 
 
77 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  73.68 
 
 
75 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  72.37 
 
 
75 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  72.37 
 
 
75 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  75 
 
 
75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  73.68 
 
 
75 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  71.05 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  69.74 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  69.74 
 
 
75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  68.42 
 
 
75 aa  110  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  64.47 
 
 
76 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  67.11 
 
 
75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  64.47 
 
 
75 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  64.47 
 
 
75 aa  105  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  65.79 
 
 
75 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  64.38 
 
 
76 aa  102  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  61.84 
 
 
75 aa  102  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  59.21 
 
 
75 aa  100  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  60.53 
 
 
81 aa  100  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  60.76 
 
 
82 aa  100  8e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  63.16 
 
 
77 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  64.79 
 
 
76 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  63.01 
 
 
81 aa  98.2  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  60.53 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  63.38 
 
 
76 aa  97.4  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  57.89 
 
 
76 aa  95.5  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  57.89 
 
 
75 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  59.15 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  55.41 
 
 
74 aa  89.4  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  54.93 
 
 
76 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  52.11 
 
 
78 aa  85.5  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  50.7 
 
 
77 aa  82  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  50.7 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  48.57 
 
 
78 aa  79.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  46.38 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  42.47 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  47.14 
 
 
76 aa  76.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  48.57 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  59.26 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  46.05 
 
 
83 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  48.57 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  48.57 
 
 
79 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  50 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  44.74 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  47.89 
 
 
103 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  47.14 
 
 
79 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  42.47 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  58.18 
 
 
83 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  45.71 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  61.11 
 
 
79 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  44.93 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  46.67 
 
 
75 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  44 
 
 
76 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  47.14 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45 
 
 
75 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  52.83 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  52.94 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3777  SirA family protein  51.67 
 
 
60 aa  67.4  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  40.28 
 
 
80 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  40.28 
 
 
80 aa  67  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.06 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  50.94 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  37.33 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  45.71 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  42.03 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  44.29 
 
 
213 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  37.33 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  38.67 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  39.44 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1905  SirA family protein  45.28 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  39.39 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  36.49 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  38.67 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  37.14 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  37.68 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  61.36 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  37.5 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  42.42 
 
 
80 aa  61.2  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  40.3 
 
 
84 aa  61.2  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>