296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2557 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  76.06 
 
 
75 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  65.79 
 
 
76 aa  107  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  69.01 
 
 
75 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  63.16 
 
 
76 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  65.71 
 
 
75 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  64.29 
 
 
75 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  64.29 
 
 
75 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  64.29 
 
 
75 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  64.29 
 
 
75 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  60.81 
 
 
75 aa  98.6  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  60.56 
 
 
75 aa  98.6  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  59.15 
 
 
77 aa  97.4  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  63.38 
 
 
75 aa  97.1  8e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  55.41 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  62.86 
 
 
75 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  57.33 
 
 
76 aa  95.9  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  59.15 
 
 
76 aa  94.7  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  59.15 
 
 
75 aa  94.4  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  56.58 
 
 
76 aa  94  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  59.15 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  56.76 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  56.76 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  58.57 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  58.57 
 
 
75 aa  92.4  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  57.14 
 
 
75 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  51.35 
 
 
77 aa  90.9  5e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  54.29 
 
 
75 aa  90.5  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  57.75 
 
 
76 aa  89.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  54.05 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  55.41 
 
 
77 aa  88.2  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  50 
 
 
78 aa  88.6  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  55.88 
 
 
78 aa  87.4  5e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  55.7 
 
 
82 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  53.33 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  53.33 
 
 
78 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  51.32 
 
 
76 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  54.17 
 
 
74 aa  85.9  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  54.41 
 
 
78 aa  85.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  57.35 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  51.47 
 
 
77 aa  82.8  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  52.94 
 
 
103 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  55.88 
 
 
81 aa  82.4  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  52.78 
 
 
80 aa  82.4  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  48.61 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  38.89 
 
 
78 aa  78.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  48.61 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  48.61 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  50 
 
 
78 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  48.61 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  48.61 
 
 
79 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  48 
 
 
79 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  50.7 
 
 
75 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  48.68 
 
 
76 aa  76.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  51.32 
 
 
80 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  46.67 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  47.89 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  48.61 
 
 
83 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  47.89 
 
 
75 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  47.22 
 
 
83 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  46.05 
 
 
189 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  42.47 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  44.74 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  43.42 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  48.61 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  49.3 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  45.07 
 
 
75 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  43.42 
 
 
189 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  44.29 
 
 
75 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  48.61 
 
 
79 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  43.66 
 
 
75 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  46.48 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  44.93 
 
 
81 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  42.11 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  38.89 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  43.66 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3777  SirA family protein  50 
 
 
60 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  42.25 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  43.66 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  42.25 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  43.06 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  40.28 
 
 
81 aa  67  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  43.48 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>