236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1311 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  100 
 
 
200 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  73.02 
 
 
189 aa  288  5.0000000000000004e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  41.67 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  41.67 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  39.24 
 
 
80 aa  70.1  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  46.03 
 
 
72 aa  68.6  0.00000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.79 
 
 
831 aa  64.3  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.89 
 
 
813 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  42.86 
 
 
79 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  61.6  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  39.13 
 
 
354 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
354 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  39.13 
 
 
354 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  37.68 
 
 
75 aa  60.5  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  38.57 
 
 
75 aa  60.1  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  36.36 
 
 
75 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  44.26 
 
 
189 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  39.73 
 
 
75 aa  59.3  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  42.25 
 
 
85 aa  58.2  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  38.57 
 
 
80 aa  58.2  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  41.18 
 
 
75 aa  57.4  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.58 
 
 
817 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  41.18 
 
 
75 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.67 
 
 
75 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  38.24 
 
 
75 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  32.47 
 
 
92 aa  56.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  39.71 
 
 
75 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  40.98 
 
 
75 aa  55.8  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  35.53 
 
 
75 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  38.24 
 
 
75 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  39.19 
 
 
76 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  35.53 
 
 
77 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  34.62 
 
 
81 aa  55.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  45.45 
 
 
76 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.5  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  37.31 
 
 
79 aa  55.5  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  35.29 
 
 
80 aa  55.5  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  39.44 
 
 
76 aa  55.5  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  35.29 
 
 
77 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  37.29 
 
 
77 aa  55.1  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  35.53 
 
 
75 aa  54.7  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  34.67 
 
 
75 aa  54.7  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  34.29 
 
 
76 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  35.53 
 
 
76 aa  54.3  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  33.75 
 
 
84 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  39.68 
 
 
75 aa  53.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.33 
 
 
189 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  30.43 
 
 
78 aa  53.5  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  31.65 
 
 
938 aa  52.8  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  52.8  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  33.82 
 
 
78 aa  53.1  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  30.3 
 
 
81 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  37.14 
 
 
80 aa  52.8  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  48.94 
 
 
76 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  31.33 
 
 
81 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  39.71 
 
 
75 aa  52.4  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  32.86 
 
 
77 aa  52.8  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.23 
 
 
817 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.03 
 
 
864 aa  52.4  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.48 
 
 
201 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  32.84 
 
 
78 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  32.39 
 
 
76 aa  52  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3149  SirA family protein  34.29 
 
 
89 aa  52  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0259716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  28.75 
 
 
356 aa  51.6  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  33.33 
 
 
78 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  37.68 
 
 
76 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  32.35 
 
 
75 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  45.28 
 
 
76 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  36.51 
 
 
75 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
354 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  33.82 
 
 
354 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  42.59 
 
 
76 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.43 
 
 
76 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  34.62 
 
 
560 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  30.99 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  43.14 
 
 
74 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  32.89 
 
 
77 aa  50.1  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  37.5 
 
 
80 aa  49.7  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  38 
 
 
78 aa  49.7  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>