More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0669 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  100 
 
 		 78 aa  161  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  48.65 
 
 		 80 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  43.75 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  44.44 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  44.44 
 
 		 80 aa  72  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  39.47 
 
 		 77 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  38.96 
 
 		 78 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  38.36 
 
 		 74 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  44.29 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  41.1 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  38.46 
 
 		 78 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  42.65 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  39.73 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  39.71 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.73 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  40.79 
 
 		 77 aa  63.5  0.0000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  42.65 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  39.71 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.25 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  41.1 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  38.24 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  37.66 
 
 		 78 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  39.44 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  41.18 
 
 		 76 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  38.24 
 
 		 72 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  39.73 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  39.73 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  36.99 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  37.66 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  37.5 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  42.65 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  36.84 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  39.44 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  39.47 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.16 
 
 		 813 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  42.47 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  32.89 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  34.72 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  45.16 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  34.21 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  35.29 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  36.25 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.24 
 
 		 81 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  34.21 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  32.89 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  32.89 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.21 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  40 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.73 
 
 		 831 aa  57.4  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  36.11 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  46.55 
 
 		 81 aa  57  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.44 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.21 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  38.57 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  42.25 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  38.16 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.14 
 
 		 76 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  46.55 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  37.84 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  38.36 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  30.26 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  32 
 
 		 83 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  37.5 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.24 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  31.58 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  36.76 
 
 		 78 aa  55.1  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  44.83 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  35.53 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  35.62 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  39.71 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  38.36 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  38.36 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  40.68 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>