More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1670 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  100 
 
 		 80 aa  166  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  50 
 
 		 78 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  48.61 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  51.35 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  46.05 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  48.65 
 
 		 78 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  44.74 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  42.11 
 
 		 78 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  42.5 
 
 		 80 aa  75.1  0.0000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  40.79 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  43.75 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  43.75 
 
 		 80 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  49.3 
 
 		 75 aa  68.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  44.44 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  44.29 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  40 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  40 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  38.67 
 
 		 186 aa  67  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  38.67 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  40.58 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.06 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  38.67 
 
 		 81 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.33 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.33 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  38.16 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  41.1 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  36 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  40.58 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  36.99 
 
 		 76 aa  64.7  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  46.48 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  34.18 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  34.18 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  39.13 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  39.13 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40 
 
 		 189 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 		 186 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  40.58 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  38.89 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  40.85 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  40.58 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  38.03 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.03 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  32.91 
 
 		 79 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  42.03 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  42.03 
 
 		 75 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  38.03 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  39.71 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  35.06 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  39.13 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  36.11 
 
 		 79 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  34.67 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  38.03 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  40.85 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  37.5 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  39.13 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  36 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  34.72 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  36.49 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  37.14 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  33.75 
 
 		 81 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  32.53 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  31.65 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  34.72 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  36 
 
 		 77 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  38.57 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  30.86 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  34.72 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  31.65 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  38.03 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  34.72 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  38.57 
 
 		 77 aa  57  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.68 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  34.67 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  39.13 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  37.97 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  34.72 
 
 		 78 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  35.21 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  30.26 
 
 		 80 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  30.26 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  30.26 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  32.47 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  36 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  36.23 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  35.71 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>