More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2377 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  100 
 
 		 75 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  82.67 
 
 		 77 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  77.33 
 
 		 75 aa  131  3e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  78.67 
 
 		 75 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  80 
 
 		 75 aa  130  6e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  80 
 
 		 75 aa  130  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  78.67 
 
 		 75 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  77.33 
 
 		 75 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  74.67 
 
 		 75 aa  125  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  72 
 
 		 75 aa  121  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  68 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  68 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  69.74 
 
 		 76 aa  110  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  65.33 
 
 		 75 aa  106  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  65.79 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  104  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  64 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  58.67 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  62.67 
 
 		 75 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  63.16 
 
 		 78 aa  102  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  60 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  64.47 
 
 		 76 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  59.72 
 
 		 76 aa  101  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  58.67 
 
 		 76 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  61.33 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  61.33 
 
 		 77 aa  100  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  56.16 
 
 		 76 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  60.81 
 
 		 76 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  60.81 
 
 		 76 aa  98.6  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  56 
 
 		 75 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  54.67 
 
 		 81 aa  92  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  54.79 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  57.75 
 
 		 74 aa  89.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  53.42 
 
 		 81 aa  89.4  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  51.9 
 
 		 82 aa  87.8  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  55.88 
 
 		 77 aa  85.9  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  52 
 
 		 83 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  50 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  50 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  50 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  52.11 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  52.11 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  50.7 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  52.78 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  45.33 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  52.78 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  52.11 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  47.14 
 
 		 78 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  47.95 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  51.39 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  45.71 
 
 		 78 aa  76.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  44 
 
 		 78 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  46.58 
 
 		 85 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  44.59 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  47.89 
 
 		 80 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  37.5 
 
 		 78 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  42.86 
 
 		 77 aa  72.8  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  44.29 
 
 		 78 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  45.95 
 
 		 81 aa  72.4  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  48.65 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  46.38 
 
 		 81 aa  71.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  41.03 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  50.72 
 
 		 85 aa  71.2  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40.28 
 
 		 201 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  44.29 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  41.89 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  43.08 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  41.1 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  40.54 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  43.84 
 
 		 81 aa  68.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  37.84 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45.16 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  37.84 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  43.84 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  42.03 
 
 		 81 aa  68.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  37.84 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  45.16 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  37.84 
 
 		 186 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  40 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  41.1 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  42.62 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  46.38 
 
 		 92 aa  66.6  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  40.54 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>