198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1803 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1803  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  158  2e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00452697  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0485  SirA family protein  69.74 
 
 
80 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00971722 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1404  SirA family protein  52.05 
 
 
85 aa  72  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0684683  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  42.03 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  42.03 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  44.78 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  44.78 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  44.78 
 
 
354 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.71 
 
 
831 aa  63.9  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  37.5 
 
 
92 aa  62.8  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  41.18 
 
 
78 aa  62.8  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0073  rhodanese domain-containing protein  44.62 
 
 
354 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0075  rhodanese domain-containing protein  44.62 
 
 
354 aa  62.8  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.23 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.76 
 
 
813 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  38.24 
 
 
81 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.9 
 
 
817 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  42.62 
 
 
72 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  44.07 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  44.07 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  41.1 
 
 
938 aa  57.8  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  38.03 
 
 
77 aa  57.4  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  39.44 
 
 
189 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2416  SirA family protein  47.37 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0668524  normal  0.999946 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0775  SirA family protein  42.11 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  39.19 
 
 
356 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  41.27 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  41.27 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3470  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.3 
 
 
864 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  45.76 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  44.07 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  45.76 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  36.99 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  38.36 
 
 
75 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  41.27 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  41.27 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  44.07 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  41.27 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  41.27 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  41.27 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  42.37 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.33 
 
 
189 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  41.27 
 
 
78 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  46.3 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1144  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  38.98 
 
 
817 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000586256  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  44.26 
 
 
77 aa  54.3  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  33.33 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  41.27 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  38.24 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  37.7 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  31.25 
 
 
189 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  32.84 
 
 
200 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  41.27 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  32 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  32 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  32 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  35.48 
 
 
77 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  38.46 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  38.33 
 
 
78 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 
837 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  45.28 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  37.14 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  36.51 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  39.68 
 
 
74 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  34.85 
 
 
75 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  34.43 
 
 
79 aa  50.1  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  39.68 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  37.1 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  35.71 
 
 
820 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  35.94 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  36.36 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.84 
 
 
834 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  32.81 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  36.76 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.39 
 
 
201 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  36.11 
 
 
81 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  32.89 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  39.68 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  46.3 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  37.88 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  35.29 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  36.62 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  37.88 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  35.82 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  32.89 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  32.89 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0357  SirA family protein  39.68 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000105762  hitchhiker  0.000384401 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.29 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  35.48 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  38.89 
 
 
76 aa  47  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  35 
 
 
75 aa  47  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>