87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0387 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0387  SirA family protein  100 
 
 		 101 aa  205  2e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0547141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1216  SirA family protein  62.69 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.439004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  48.44 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  44.44 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  34.92 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.92 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  34.92 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0119  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.93 
 
 		 813 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  43.1 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  32.88 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  34.48 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  31.82 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  31.82 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  42.22 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  35.94 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  37.7 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  41.27 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  31.82 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  35.21 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  41.82 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  38.46 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  32.26 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  38.46 
 
 		 83 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2515  rhodanese-like domain-containing protein  38.98 
 
 		 354 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.411992  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0035  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 354 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0035  rhodanese domain-containing protein  38.98 
 
 		 354 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  33.33 
 
 		 200 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  32.81 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  33.87 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  36.07 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  32.76 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  37.31 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  33.93 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  41.82 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  29.58 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  30.3 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  36.07 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  29.58 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  43.4 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  37.29 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  38.71 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  37.29 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  30.3 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  35.59 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  38.3 
 
 		 77 aa  42  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02400  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.21 
 
 		 831 aa  42  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  30.99 
 
 		 75 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 356 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  37.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  32.76 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0094  SirA family protein  33.9 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249319  normal  0.118348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  37.7 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  38.46 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4890  hypothetical protein  36.17 
 
 		 220 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.257477 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  40.62 
 
 		 201 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2967  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.88 
 
 		 817 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  29.03 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  30.3 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  35.48 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  34.85 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.07 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  35.48 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  28.05 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  34.43 
 
 		 81 aa  40  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>