89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0094 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0094  SirA family protein  100 
 
 		 97 aa  199  8e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249319  normal  0.118348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  42.11 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  37.5 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  34.55 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  38.6 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  32.86 
 
 		 189 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  35.21 
 
 		 78 aa  47  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  27.27 
 
 		 201 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  38 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  34.29 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  34.78 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  31.94 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  28.57 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  29.17 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  28.38 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  28.36 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  31.58 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  31.48 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  32.84 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  33.93 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  26.39 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  26.39 
 
 		 194 aa  42.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  42.86 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  25.32 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  28.36 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  26.67 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  22.06 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  30.19 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  28.17 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  29.55 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  32.86 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  25.76 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 80 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  27.27 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  27.78 
 
 		 186 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  27.78 
 
 		 186 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  28.36 
 
 		 75 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  46.3 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1151  SirA family protein  42 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000431331  decreased coverage  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  32.35 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  22.06 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0387  SirA family protein  33.9 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0547141 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  25.45 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  30.56 
 
 		 78 aa  41.2  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  27.27 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  29.09 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  25.93 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  20.59 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  25.93 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  25.93 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  25.45 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  24.24 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  25.45 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  24.64 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  25.45 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  24.32 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  22.06 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  24.32 
 
 		 186 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  25.93 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  25.76 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  36.73 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  28.33 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  31.03 
 
 		 86 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  28.81 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  28.81 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  30 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  25.45 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  30.16 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  29.69 
 
 		 84 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  32.35 
 
 		 77 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  38.1 
 
 		 83 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>