174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1287 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  100 
 
 		 104 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  73.81 
 
 		 89 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  59.04 
 
 		 82 aa  97.8  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  67.57 
 
 		 115 aa  97.1  8e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  64.47 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  47.14 
 
 		 76 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  47.22 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  36.99 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  51.92 
 
 		 74 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  35.06 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  35.06 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  44.29 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  36.62 
 
 		 72 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  34.62 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  39.13 
 
 		 80 aa  57  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  35.21 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0383  SirA family protein  36.99 
 
 		 78 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.472232  normal  0.0141536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  30.43 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  36.11 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  41.43 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  40 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  39.62 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  37.68 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  28.99 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  32.81 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  40 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.5 
 
 		 201 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  39.22 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3119  putative aminotransferase  43.33 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.711998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.94 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  36.36 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  38.89 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  37.93 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1799  SirA family protein  57.41 
 
 		 79 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  39.22 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  38.03 
 
 		 80 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  36.62 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  34.55 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  33.8 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  40 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  37.04 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  37.29 
 
 		 78 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  38.18 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  37.25 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  36.36 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  36.36 
 
 		 83 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  34.55 
 
 		 99 aa  50.1  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  34.48 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  30 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  35.19 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  27.63 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.07 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  44.44 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  33.33 
 
 		 938 aa  48.9  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  34.48 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.34 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.34 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1710  SirA family protein  34.44 
 
 		 560 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0499089 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.99 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  34.29 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  45.07 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  38.03 
 
 		 78 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  31.58 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  28.17 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  38 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  31.43 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2236  SirA family protein  31.82 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.278986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>