249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3534 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  100 
 
 
76 aa  152  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  86.84 
 
 
76 aa  135  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  44.29 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  47.83 
 
 
115 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  45.71 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  47.22 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  45.71 
 
 
89 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  60.87 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  41.89 
 
 
75 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  44.62 
 
 
81 aa  62  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  60.42 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  43.06 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  31.43 
 
 
72 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  55.56 
 
 
110 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  45.45 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  41.67 
 
 
75 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  34.25 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  37.88 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  36 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  43.55 
 
 
81 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  37.14 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  44.93 
 
 
80 aa  53.5  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  48.94 
 
 
200 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.26 
 
 
201 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  40 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  32.86 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  38.24 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  40.85 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  35.14 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  42.11 
 
 
81 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  33.33 
 
 
74 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  33.78 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  33.78 
 
 
80 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3119  putative aminotransferase  46.67 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.711998  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1799  SirA family protein  47.83 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  28.57 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  29.11 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  32.86 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  34.29 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  44.68 
 
 
189 aa  50.4  0.000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  34.48 
 
 
81 aa  50.1  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  28.57 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  23.19 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  40 
 
 
78 aa  50.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  28.57 
 
 
186 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4162  SirA family protein  31.94 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0094  SirA family protein  38.6 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249319  normal  0.118348 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  27.14 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  35.09 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4046  SirA-like  30 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  34.29 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  32.76 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  32.89 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4189  SirA family protein  31.94 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  40 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  40 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30.67 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  27.14 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0815  SirA family protein  30.65 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  25.71 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  41.07 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  30.67 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  33.82 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  25.71 
 
 
186 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  31.88 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1186  SirA family protein  30.65 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  35.09 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  25.71 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  28.77 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  33.87 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  31.17 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  40 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0524  SirA family protein  33.78 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.842922 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  43.75 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  24.64 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  32.14 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4317  hypothetical protein  40.74 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  29.33 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  46.81 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4295  hypothetical protein  40.74 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0603535  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  29.33 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  32 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  27.54 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  27.03 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  31.88 
 
 
78 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  35.09 
 
 
81 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.106509 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  29.33 
 
 
81 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  37.5 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  32 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  33.33 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  28.99 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  35.94 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  29.33 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 
81 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  29.33 
 
 
75 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.960057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>