99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0830 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  100 
 
 
82 aa  166  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  67.5 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  50 
 
 
89 aa  87  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  55.88 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  61.7 
 
 
325 aa  64.3  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  40.28 
 
 
324 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  41.67 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  43.86 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  41.07 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  35.62 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  39.47 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  39.47 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  45.45 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  37.68 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  32.86 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  29.58 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  37.5 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  31.94 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  34.29 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  36.51 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  35.94 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  35.94 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  35.94 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  49.02 
 
 
204 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  34.43 
 
 
81 aa  44.3  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  35.71 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  34.55 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  35.19 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.71 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  33.33 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  30.67 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  34.38 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  31.51 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  33.77 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  34.38 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  31.51 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  31.51 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  34.38 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  31.51 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  31.51 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  34.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  34.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  34.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  34.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  34.38 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  37.25 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  30 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  33.77 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  35 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  33.87 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  30.14 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  36.51 
 
 
74 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  38 
 
 
81 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  34.38 
 
 
77 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  32.39 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  37.5 
 
 
75 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  31.25 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  31.25 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  33.85 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  39.62 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  31.25 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  31.94 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  31.51 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  31.51 
 
 
80 aa  41.2  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  31.67 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  32.39 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  31.25 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  28.75 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1644  SirA family protein  33.33 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  31.25 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  32.39 
 
 
101 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  32.39 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  29.51 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>