153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0446 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  69.74 
 
 
79 aa  117  4.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  69.33 
 
 
77 aa  115  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  70.67 
 
 
77 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  71.62 
 
 
77 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  69.74 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  69.74 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  69.74 
 
 
89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  69.33 
 
 
77 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  69.86 
 
 
77 aa  114  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  69.86 
 
 
77 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  69.86 
 
 
77 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  69.86 
 
 
77 aa  114  6e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  71.23 
 
 
77 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  71.23 
 
 
77 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  71.23 
 
 
77 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  58.57 
 
 
75 aa  97.4  5e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  57.14 
 
 
75 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  57.14 
 
 
75 aa  93.6  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  57.14 
 
 
75 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  58.57 
 
 
78 aa  93.2  9e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  50.68 
 
 
81 aa  92  2e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  46.48 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  49.33 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  46.48 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  45.76 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.71 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  45 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  45 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  41.1 
 
 
78 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  41.43 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.24 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  36.76 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  36.67 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.76 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  36.23 
 
 
80 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  42.19 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  37.7 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  37.7 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  37.7 
 
 
75 aa  50.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  37.7 
 
 
76 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  36.76 
 
 
75 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.76 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.59 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.43 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  42.11 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.07 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  35.62 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  38.57 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  46.67 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  32.05 
 
 
194 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  35.48 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 
186 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  31.34 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  32.89 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  31.94 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  33.33 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  35.71 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  31.25 
 
 
81 aa  45.4  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  29.17 
 
 
111 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  30.26 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  30.77 
 
 
79 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.67 
 
 
77 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  29.58 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  33.77 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  32.2 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  32.2 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  35 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  32.35 
 
 
70 aa  43.9  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  38.18 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  28.99 
 
 
77 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  27.4 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  30.43 
 
 
72 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  33.9 
 
 
74 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  27.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  27.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  30 
 
 
78 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  27.63 
 
 
78 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  30.67 
 
 
186 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  27.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  27.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  27.78 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>