60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4184 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  42.86 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  41.98 
 
 		 80 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  44.44 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  47.27 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  36.59 
 
 		 81 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  43.55 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  46.55 
 
 		 83 aa  53.5  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  44.07 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  42.37 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  34.92 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  40.74 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  40.74 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  41.38 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  42.86 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  44.83 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  42.62 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  37.68 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  42.31 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  34.92 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  44.64 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  41.51 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  41.07 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  46.15 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  38.98 
 
 		 89 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  33.87 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  42.31 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  37.93 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  38.6 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  35.59 
 
 		 796 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  36.51 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  43.75 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  34.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  38.1 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  34.62 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  36.54 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  41.54 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  38.46 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  37.74 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  35.59 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  41.82 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  36.54 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  43.86 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  31.71 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  36.51 
 
 		 88 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  34.09 
 
 		 116 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  36.54 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  32.2 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  27.71 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  30.59 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.14 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.37 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.76 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  32.69 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  33.87 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  34.62 
 
 		 89 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.15 
 
 		 75 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>