27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0379 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  100 
 
 		 325 aa  664    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  32.62 
 
 		 324 aa  188  1e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  52.11 
 
 		 84 aa  75.5  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  50 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  61.7 
 
 		 82 aa  64.3  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  46.43 
 
 		 79 aa  53.5  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  46.43 
 
 		 79 aa  53.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  57.14 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 184 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  51.35 
 
 		 78 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  48.72 
 
 		 75 aa  46.2  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  40.35 
 
 		 81 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  46.81 
 
 		 78 aa  45.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  32.1 
 
 		 85 aa  45.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  44.68 
 
 		 89 aa  45.1  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  37.1 
 
 		 94 aa  44.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  44.68 
 
 		 75 aa  43.9  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  26.26 
 
 		 101 aa  43.9  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  47.83 
 
 		 73 aa  43.5  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  42.5 
 
 		 77 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  42.5 
 
 		 77 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  42.5 
 
 		 77 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2705  SirA family protein  41.67 
 
 		 81 aa  42.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  42.55 
 
 		 75 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  33.33 
 
 		 91 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  42.55 
 
 		 75 aa  42.4  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>