154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0642 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  95.95 
 
 
79 aa  148  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  94.59 
 
 
77 aa  147  6e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  93.24 
 
 
77 aa  146  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  93.24 
 
 
77 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  91.89 
 
 
77 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  89.04 
 
 
77 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  89.04 
 
 
77 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  89.04 
 
 
77 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  87.67 
 
 
77 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  87.67 
 
 
77 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  87.67 
 
 
77 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  87.67 
 
 
77 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  69.74 
 
 
78 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  64.29 
 
 
75 aa  103  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  56.76 
 
 
75 aa  103  8e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  62.86 
 
 
75 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  62.86 
 
 
75 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  58.9 
 
 
81 aa  101  3e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  60 
 
 
78 aa  101  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  45.45 
 
 
82 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  40.51 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  44.29 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  47.54 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  47.54 
 
 
79 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  41.18 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  41.33 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  41.54 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.82 
 
 
75 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.29 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.71 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.71 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  35.14 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  43.86 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  35.62 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  45.65 
 
 
76 aa  51.2  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  36.23 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.7 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.82 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  33.82 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  30.26 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  36.76 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  36.76 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  33.82 
 
 
75 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  28.77 
 
 
73 aa  47  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  32.47 
 
 
91 aa  47  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  38.89 
 
 
82 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  36.76 
 
 
93 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  32.35 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  37.68 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  35.82 
 
 
78 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  34.21 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  30.88 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  37.14 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  36.23 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  35.59 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  32.39 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  28.77 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
184 aa  44.7  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  34.78 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  28.21 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  35.59 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  36.21 
 
 
76 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  30.88 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>