104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0894 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  100 
 
 		 89 aa  181  4.0000000000000006e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  51.81 
 
 		 84 aa  87.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0830  SirA family protein  50 
 
 		 82 aa  87  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.183754  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  43.06 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  36.11 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  39.19 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  39.19 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0422  hypothetical protein  38.24 
 
 		 213 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  35.82 
 
 		 72 aa  47.8  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  28.57 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  41.18 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  37.14 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  35.53 
 
 		 78 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  36.21 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  36.92 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  37.14 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  36.92 
 
 		 79 aa  45.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  36.49 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0833  conserved hypothetical protein  36 
 
 		 324 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.68141  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  44.68 
 
 		 325 aa  45.1  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  33.78 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2228  SirA family protein  26.39 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.976785 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2715  SirA family protein  26.39 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2600  hypothetical protein  26.39 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3117  hypothetical protein  26.39 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  33.33 
 
 		 189 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  34.25 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  31.17 
 
 		 80 aa  43.9  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  31.17 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  36.11 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  40.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  40.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  40.82 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  29.87 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  24.29 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  28.36 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  36.76 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  29.87 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  35.21 
 
 		 79 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  29.21 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.35 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  31.67 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2399  SirA-like  29.41 
 
 		 74 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.433209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  30.99 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.88 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  38.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2083  SirA family protein  26.39 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  34.38 
 
 		 189 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0029  redox protein regulator of disulfide bond formation  33.8 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0748983  normal  0.0110056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  31.67 
 
 		 76 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  38 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  38.78 
 
 		 81 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  38.78 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1887  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.405491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  34.72 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  31.88 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  35.82 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  32.26 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  33.85 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  32.1 
 
 		 84 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  36.73 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0598  SirA family protein  30 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  25 
 
 		 181 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  34.62 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>