128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1475 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  100 
 
 		 82 aa  169  1e-41  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  57.53 
 
 		 81 aa  93.2  1e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  54.05 
 
 		 82 aa  86.7  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  32.91 
 
 		 85 aa  67  0.00000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  40.79 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  43.42 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  40 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  40.58 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  41.38 
 
 		 88 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.13 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.13 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  37.68 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  36.62 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  40 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  42.19 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  40.28 
 
 		 79 aa  50.4  0.000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  32.86 
 
 		 77 aa  50.4  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  34.72 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  40.28 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  38.03 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  35.82 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  35.82 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  38.89 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  35.71 
 
 		 70 aa  48.9  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  35.71 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  40.74 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  32.91 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.21 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  44.44 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  34.29 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  37.14 
 
 		 78 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  39.66 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  38.89 
 
 		 89 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  38.6 
 
 		 103 aa  47  0.00009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  34.29 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.58 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  34.43 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  33.33 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  34.78 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  36.21 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  34.43 
 
 		 88 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  35.19 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  36.36 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  30 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.43 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  36.76 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  33.33 
 
 		 201 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  36.76 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  36.67 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  34.55 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  35.29 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  35.29 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  26.92 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  30 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  32.73 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  35.19 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  30 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  30.43 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  30.51 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.85 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  36.84 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  29.23 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  27.87 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  31.51 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  27.42 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  32.14 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.93 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  29.73 
 
 		 75 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  32.81 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  26.92 
 
 		 92 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  27.14 
 
 		 77 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  30 
 
 		 78 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.67 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  32.76 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  30.56 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  29.51 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.2 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  31.58 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  27.14 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>