140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0584 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  100 
 
 
85 aa  174  5e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  45.21 
 
 
81 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  42.25 
 
 
78 aa  67.4  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  32.91 
 
 
82 aa  67  0.00000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  41.43 
 
 
82 aa  60.1  0.000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  38.67 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  36.92 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  36.92 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  42.25 
 
 
73 aa  53.9  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  35.38 
 
 
73 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  28.92 
 
 
83 aa  52  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.8 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  40 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  30 
 
 
77 aa  50.1  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  36.23 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  32.88 
 
 
92 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  35.21 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  32.88 
 
 
92 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  37.14 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.17 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.26 
 
 
77 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  31.71 
 
 
92 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  36.23 
 
 
78 aa  47.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  40 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  34.78 
 
 
74 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  35.71 
 
 
70 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  36.23 
 
 
77 aa  47  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  42.55 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  29.03 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  34.72 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  38.3 
 
 
72 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  28.38 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  32.1 
 
 
325 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  34.29 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  31.51 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  30.65 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  35 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  41.51 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  39.29 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.17 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  30.99 
 
 
91 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  34.29 
 
 
70 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  29.58 
 
 
74 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  32 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  32.39 
 
 
199 aa  43.9  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  28.21 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1739  hypothetical protein  36.21 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.626352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1606  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.33 
 
 
837 aa  42.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.224232  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  28.33 
 
 
81 aa  42.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  29.58 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  29.58 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  25.71 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4368  SirA family protein  31.94 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  31.08 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0062  SirA family protein  33.85 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  32 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  33.33 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  29.58 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  37.74 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  42.31 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  24 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  40.48 
 
 
199 aa  42.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  38.18 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  32 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  30.88 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7291  SirA family protein  35.48 
 
 
87 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  28.81 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  35.71 
 
 
200 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  28.33 
 
 
76 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5996  SirA family protein  40.38 
 
 
89 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00696256 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  25.71 
 
 
75 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  26.67 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  27.03 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  30.43 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  32.79 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5387  SirA family protein  34.43 
 
 
89 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.895582  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  24.29 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  35.59 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>