54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0367 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  100 
 
 
199 aa  396  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  50.98 
 
 
197 aa  195  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  46.95 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  41.24 
 
 
204 aa  158  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40 
 
 
203 aa  152  4e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  43.22 
 
 
190 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  43.22 
 
 
190 aa  151  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  41.71 
 
 
201 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  38.54 
 
 
197 aa  141  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  37.17 
 
 
193 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.03 
 
 
199 aa  134  8e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  34.69 
 
 
195 aa  134  9e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  34.34 
 
 
196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  36.27 
 
 
203 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  36.84 
 
 
199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  39.15 
 
 
195 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  34.01 
 
 
195 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.67 
 
 
193 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  33.67 
 
 
196 aa  122  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  31.98 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  32.52 
 
 
204 aa  117  9.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  35.6 
 
 
196 aa  109  3e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  31.25 
 
 
204 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  31.96 
 
 
197 aa  104  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  33.68 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  40.78 
 
 
114 aa  99  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  31.09 
 
 
198 aa  94.7  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  31.58 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  28.57 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  29.32 
 
 
206 aa  91.3  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  29.33 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  30.39 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  30.21 
 
 
199 aa  88.6  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  29.61 
 
 
200 aa  86.3  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  39.42 
 
 
118 aa  84.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.98 
 
 
189 aa  84.3  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  26.4 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  31.18 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  26.87 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  37.11 
 
 
117 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  29.79 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  24.87 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  34.02 
 
 
119 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  32.08 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  27.86 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  29.91 
 
 
140 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  36.11 
 
 
72 aa  55.1  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  38.03 
 
 
75 aa  48.1  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  32.39 
 
 
75 aa  46.2  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  32.39 
 
 
85 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  34.72 
 
 
73 aa  41.6  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>