51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1060 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  420  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  51.89 
 
 
214 aa  218  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  53.81 
 
 
212 aa  208  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  51.46 
 
 
208 aa  207  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  48.06 
 
 
211 aa  192  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  42.08 
 
 
204 aa  182  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  47.09 
 
 
209 aa  181  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  43.56 
 
 
200 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  42.65 
 
 
197 aa  168  6e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.93 
 
 
196 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  33.99 
 
 
199 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.17 
 
 
199 aa  121  7e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  33.66 
 
 
190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  33.66 
 
 
190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  37.44 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  34.16 
 
 
195 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  34.98 
 
 
196 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  33.67 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  42.52 
 
 
140 aa  112  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  33.81 
 
 
204 aa  112  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  33.83 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.13 
 
 
203 aa  105  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  33.49 
 
 
193 aa  105  5e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  34.48 
 
 
195 aa  105  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  30.99 
 
 
223 aa  104  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  33.99 
 
 
195 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  44.63 
 
 
119 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  43.8 
 
 
119 aa  98.6  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  38.42 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  29 
 
 
199 aa  97.8  9e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  28.43 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  34.33 
 
 
198 aa  95.9  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  42.37 
 
 
117 aa  93.2  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  29.59 
 
 
199 aa  92.4  4e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  28.92 
 
 
201 aa  91.3  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  29.32 
 
 
199 aa  91.3  9e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  28.16 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  30.95 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  30.21 
 
 
197 aa  88.2  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  28.16 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  28.78 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  37.5 
 
 
114 aa  84  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  28.16 
 
 
190 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  28.16 
 
 
190 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  28.92 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  28.14 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  40 
 
 
118 aa  75.9  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  27.69 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  35.82 
 
 
76 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  39.34 
 
 
74 aa  48.5  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>