49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3421 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  279  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  53.91 
 
 		 200 aa  139  9e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  49.58 
 
 		 211 aa  121  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  52.34 
 
 		 197 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  51.85 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  41.46 
 
 		 204 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  42.52 
 
 		 206 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  47.22 
 
 		 214 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  54.64 
 
 		 209 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  45.37 
 
 		 212 aa  103  9e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.32 
 
 		 199 aa  95.5  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  39.1 
 
 		 199 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  37.5 
 
 		 190 aa  88.6  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  37.61 
 
 		 195 aa  83.6  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  36.28 
 
 		 223 aa  83.6  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  34.26 
 
 		 197 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  41.12 
 
 		 204 aa  73.9  0.0000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  34.96 
 
 		 195 aa  73.6  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  39.82 
 
 		 198 aa  73.6  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  35.19 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  37.04 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  36.11 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  40 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  39.18 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  35.51 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  33.33 
 
 		 203 aa  67.4  0.00000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  35.51 
 
 		 195 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  36.11 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  33.94 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  33.94 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  33.94 
 
 		 119 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  31.78 
 
 		 114 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  35 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  31.48 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  34.75 
 
 		 118 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  29.17 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  28.66 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  29.91 
 
 		 199 aa  57.4  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.58 
 
 		 189 aa  57.4  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  30.56 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  29.9 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  28.71 
 
 		 199 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  28.18 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  25.45 
 
 		 200 aa  51.2  0.000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  34.62 
 
 		 196 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  27.37 
 
 		 200 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>