82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0807 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  52.09 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  52.38 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  51.18 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  48.06 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  45.79 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  46.12 
 
 		 197 aa  185  5e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  48.54 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  43.81 
 
 		 204 aa  174  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  39.13 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  40.58 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  37.2 
 
 		 190 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  36.71 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.81 
 
 		 199 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  35.85 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  35.29 
 
 		 195 aa  122  6e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  49.58 
 
 		 140 aa  121  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  33.82 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  33.49 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  34.47 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  37.07 
 
 		 198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  31.55 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  30.53 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  33.33 
 
 		 196 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  33.98 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  31.43 
 
 		 197 aa  108  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  33.17 
 
 		 202 aa  107  9.000000000000001e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  31.55 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  32.65 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.73 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  30.05 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  28.37 
 
 		 200 aa  98.6  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  27.7 
 
 		 199 aa  91.7  7e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  29.33 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  30.39 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  29.13 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  28.99 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  26.34 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  26.02 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  27.32 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  36.04 
 
 		 114 aa  78.2  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  26.07 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  37.5 
 
 		 118 aa  71.2  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  37.96 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  34.91 
 
 		 119 aa  64.7  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  34.91 
 
 		 119 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  40 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  41.67 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  37.29 
 
 		 71 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  41.67 
 
 		 70 aa  52  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  41.67 
 
 		 70 aa  51.2  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  38.71 
 
 		 78 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  40 
 
 		 70 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  40 
 
 		 70 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  40.68 
 
 		 70 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  36.51 
 
 		 76 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  30.86 
 
 		 94 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.7 
 
 		 75 aa  45.4  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  30.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  37.25 
 
 		 69 aa  43.9  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  23.58 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  35.29 
 
 		 79 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  35.59 
 
 		 81 aa  43.5  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  32.88 
 
 		 93 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  31.03 
 
 		 69 aa  42.4  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  37.25 
 
 		 73 aa  42.4  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  26.56 
 
 		 78 aa  42  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  34.48 
 
 		 73 aa  42  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  28.28 
 
 		 201 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  32.79 
 
 		 75 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  33.93 
 
 		 77 aa  41.6  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>