84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2521 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  77.04 
 
 		 196 aa  298  4e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  66.33 
 
 		 193 aa  254  4e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  64.8 
 
 		 195 aa  247  8e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  64.8 
 
 		 195 aa  246  2e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  55.84 
 
 		 196 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  40.91 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  45.36 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  42.05 
 
 		 193 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  43.37 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.71 
 
 		 199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  37.81 
 
 		 204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  33.64 
 
 		 223 aa  135  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  39.49 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  34.69 
 
 		 199 aa  134  9e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.21 
 
 		 203 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  36.68 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  37.17 
 
 		 197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  40.1 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  38.61 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.55 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  35.96 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  35.23 
 
 		 203 aa  119  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  39.5 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  34.16 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  35.51 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  34.54 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  32.11 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  36.04 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  31.55 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  28.87 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  28.87 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  28.35 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  31.31 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  30.05 
 
 		 199 aa  99.4  3e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  31.9 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  40.74 
 
 		 114 aa  93.2  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  32.47 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  32.06 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  30.2 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.28 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  40.35 
 
 		 117 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  40.68 
 
 		 119 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  39.83 
 
 		 119 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  25.89 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  35.45 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  34.96 
 
 		 140 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  46.15 
 
 		 72 aa  69.7  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  42.86 
 
 		 74 aa  64.3  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  42.65 
 
 		 73 aa  62.4  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  41.43 
 
 		 79 aa  61.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  43.55 
 
 		 70 aa  57.4  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  42.59 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  38.36 
 
 		 74 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  38.36 
 
 		 74 aa  52.8  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  35.82 
 
 		 69 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  40 
 
 		 69 aa  52.4  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.76 
 
 		 68 aa  52  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  39.73 
 
 		 74 aa  52  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  39.13 
 
 		 74 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  38.36 
 
 		 74 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  35 
 
 		 75 aa  47.4  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  36.36 
 
 		 73 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  33.33 
 
 		 71 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1972  SirA family protein  36.23 
 
 		 71 aa  45.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  45.71 
 
 		 92 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  42.37 
 
 		 70 aa  45.1  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  31.58 
 
 		 69 aa  44.3  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  32.84 
 
 		 68 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  39.19 
 
 		 88 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  33.33 
 
 		 76 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  32.84 
 
 		 181 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  34.43 
 
 		 76 aa  43.9  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  37.88 
 
 		 70 aa  42.4  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 		 70 aa  42  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  44.29 
 
 		 92 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  44.29 
 
 		 92 aa  41.6  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  31.82 
 
 		 70 aa  41.2  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  29.73 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>