77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1887 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  47.72 
 
 		 193 aa  178  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  44.1 
 
 		 199 aa  170  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  45.36 
 
 		 195 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  44.16 
 
 		 196 aa  157  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  43.08 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  44.9 
 
 		 190 aa  154  7e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  44.9 
 
 		 190 aa  154  8e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  44.27 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  37.56 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  43.59 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  42.93 
 
 		 193 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  40 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  39.7 
 
 		 196 aa  138  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  40.39 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  40 
 
 		 200 aa  132  5e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.31 
 
 		 201 aa  130  9e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  38.97 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  39.18 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  39.15 
 
 		 199 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  38.97 
 
 		 195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  34.31 
 
 		 204 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  37.81 
 
 		 208 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  32.85 
 
 		 214 aa  121  5e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  35.29 
 
 		 211 aa  122  5e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  35.87 
 
 		 197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  33.33 
 
 		 197 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  33.67 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  38.92 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  35.61 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  35.05 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  34.54 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  34.18 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  35.05 
 
 		 190 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  44.83 
 
 		 119 aa  101  6e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  44.74 
 
 		 119 aa  101  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  30.2 
 
 		 204 aa  99.8  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  32.67 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  37.11 
 
 		 192 aa  94.4  8e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  32.99 
 
 		 189 aa  94.7  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32.5 
 
 		 200 aa  94  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  44.95 
 
 		 117 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  32.63 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  38.89 
 
 		 114 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  37.61 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  31.61 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  30.85 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  35.4 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  48.44 
 
 		 74 aa  61.6  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  41.94 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  40.91 
 
 		 69 aa  54.3  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  39.39 
 
 		 71 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  38.89 
 
 		 79 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  34.78 
 
 		 73 aa  52  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  45.83 
 
 		 73 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25120  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  47.4  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.518593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0904  hypothetical protein  39.73 
 
 		 71 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00947642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  44.83 
 
 		 69 aa  44.7  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  39.22 
 
 		 72 aa  44.7  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.29 
 
 		 68 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  51.43 
 
 		 75 aa  43.5  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  51.43 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  42.11 
 
 		 81 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  51.43 
 
 		 75 aa  42.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  36 
 
 		 75 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  42.4  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  31.25 
 
 		 76 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0501  DsrE family protein  30.97 
 
 		 272 aa  42.4  0.005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  48.57 
 
 		 75 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  51.61 
 
 		 189 aa  41.2  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  42.11 
 
 		 81 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>