59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0368 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  62.15 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  60.83 
 
 		 212 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  52.09 
 
 		 211 aa  225  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  51.89 
 
 		 206 aa  218  6e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  45.93 
 
 		 197 aa  192  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  45.75 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  50.47 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  41.51 
 
 		 204 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  36.67 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.97 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  32.85 
 
 		 195 aa  121  7e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  36.19 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  34.13 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  35.51 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  28.23 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  28.23 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  35.1 
 
 		 196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  32.69 
 
 		 193 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  47.22 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  29.6 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  34.45 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.94 
 
 		 203 aa  101  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  31.4 
 
 		 197 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  32.86 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  35.1 
 
 		 198 aa  99  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  30.77 
 
 		 193 aa  98.6  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  34.13 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  32.49 
 
 		 196 aa  97.8  9e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  28.91 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  28.37 
 
 		 200 aa  94.4  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  31.13 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  33.17 
 
 		 195 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  28.57 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.38 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  27.94 
 
 		 199 aa  87  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  26.7 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  28.44 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  38.74 
 
 		 114 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  26.42 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  40.34 
 
 		 119 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  25.94 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  40.57 
 
 		 119 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  40.57 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  27.18 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  25 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  25.84 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  35.19 
 
 		 118 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  26.09 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  38.98 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  42.59 
 
 		 74 aa  52.8  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  42.37 
 
 		 69 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  35.19 
 
 		 71 aa  48.5  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  37.5 
 
 		 76 aa  48.1  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  40.74 
 
 		 73 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  33.33 
 
 		 72 aa  47  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  42.59 
 
 		 70 aa  45.4  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  39.29 
 
 		 70 aa  41.6  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  33.9 
 
 		 69 aa  41.6  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>