184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0339 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  48.76 
 
 		 199 aa  194  7e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  45.54 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  48 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  38.42 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  34.16 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  31.77 
 
 		 199 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  29.59 
 
 		 206 aa  92.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  27.83 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  23.81 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  32.31 
 
 		 202 aa  91.3  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  26.73 
 
 		 212 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  28.43 
 
 		 197 aa  88.6  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  24.88 
 
 		 204 aa  85.9  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  26.34 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  26.7 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  27 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  27.41 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  25.89 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  29.02 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  29.17 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  23.74 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  29.08 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  26.98 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  30.85 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.05 
 
 		 203 aa  77  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.5 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  26.4 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  27.57 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  26.39 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  24.1 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.4 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  26.02 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  25.13 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  27.86 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  25.13 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  25.89 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  25.26 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  32.26 
 
 		 118 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  35.38 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  34.02 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  34.62 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  29.9 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  33.82 
 
 		 74 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  52.4  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.48 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  37.88 
 
 		 73 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  35.94 
 
 		 81 aa  50.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  35.19 
 
 		 103 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  34.38 
 
 		 81 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  35.19 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  40.62 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  38.1 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  38.1 
 
 		 75 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  40.38 
 
 		 75 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  40.38 
 
 		 75 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  32 
 
 		 80 aa  49.7  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  41.27 
 
 		 75 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  40 
 
 		 76 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.54 
 
 		 75 aa  48.9  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  37.04 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  27.27 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  34.02 
 
 		 117 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.19 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  34.38 
 
 		 75 aa  47.8  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  30.88 
 
 		 101 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  31.25 
 
 		 78 aa  47.4  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  35.38 
 
 		 82 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.85 
 
 		 68 aa  47.8  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  36.36 
 
 		 94 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  30.88 
 
 		 97 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  34.43 
 
 		 84 aa  47.4  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  34.92 
 
 		 85 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  30.16 
 
 		 72 aa  47.8  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  35.85 
 
 		 75 aa  47.4  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  36.92 
 
 		 71 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.19 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  30 
 
 		 80 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  30 
 
 		 80 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.54 
 
 		 75 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  25.97 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  25.97 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3701  SirA family protein  37.25 
 
 		 81 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.60785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  34.62 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  38.1 
 
 		 75 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  38.1 
 
 		 75 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  33.87 
 
 		 70 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  31.25 
 
 		 92 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  28.77 
 
 		 77 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  40.91 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  40.91 
 
 		 76 aa  46.2  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  32.81 
 
 		 75 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1648  hypothetical protein  28.33 
 
 		 72 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.282998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>