76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1487 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  42.6 
 
 		 203 aa  185  4e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  43.38 
 
 		 204 aa  185  4e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  46.95 
 
 		 199 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  38.29 
 
 		 201 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  40.72 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  41.51 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  40.72 
 
 		 190 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  159  5e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  40.91 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  36.49 
 
 		 193 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  37.56 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.74 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  34.56 
 
 		 199 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  33.64 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  33.64 
 
 		 196 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  30.59 
 
 		 195 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  30.14 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  32.27 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  32.27 
 
 		 193 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  33.48 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  32.58 
 
 		 196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  28.31 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  27.88 
 
 		 204 aa  111  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  32.43 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  30.53 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  29.6 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  33.18 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  29.6 
 
 		 197 aa  106  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  30.99 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  30.8 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  31.08 
 
 		 209 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  30.52 
 
 		 198 aa  96.3  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  37.61 
 
 		 114 aa  95.9  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  38.39 
 
 		 119 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  27.85 
 
 		 200 aa  95.5  6e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  36.61 
 
 		 117 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  28.3 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  38.18 
 
 		 119 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  30.49 
 
 		 200 aa  92  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  31.05 
 
 		 192 aa  92  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  29.22 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  29.22 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  28.77 
 
 		 190 aa  87.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  27.85 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  25 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  36.28 
 
 		 140 aa  83.6  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  36.36 
 
 		 118 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  26.39 
 
 		 199 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  36.23 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  33.85 
 
 		 76 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  43.86 
 
 		 74 aa  52  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  49.02 
 
 		 76 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  49.02 
 
 		 76 aa  50.8  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  31.67 
 
 		 72 aa  50.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  41.67 
 
 		 79 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  33.33 
 
 		 83 aa  47  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  41.18 
 
 		 75 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  39.22 
 
 		 75 aa  45.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  37.25 
 
 		 75 aa  45.4  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  37.25 
 
 		 75 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  36.73 
 
 		 76 aa  44.7  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  36.11 
 
 		 94 aa  44.3  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  51.43 
 
 		 72 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  36.23 
 
 		 75 aa  43.1  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  42.55 
 
 		 76 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  35.29 
 
 		 77 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  37.25 
 
 		 75 aa  42.4  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  55.17 
 
 		 75 aa  42  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  31.17 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  53.57 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  55.56 
 
 		 77 aa  41.6  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  25.76 
 
 		 75 aa  41.6  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15610  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.96 
 
 		 110 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>