114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1242 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  100 
 
 
196 aa  394  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  47.47 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  46.46 
 
 
193 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  46.73 
 
 
196 aa  159  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  44.16 
 
 
195 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  43.88 
 
 
195 aa  155  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  40.41 
 
 
199 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  38.78 
 
 
190 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  38.27 
 
 
190 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  42.13 
 
 
196 aa  142  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  42.55 
 
 
195 aa  140  9e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  42.55 
 
 
195 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  36.27 
 
 
204 aa  138  6e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  39.09 
 
 
197 aa  137  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  38.21 
 
 
211 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  38.27 
 
 
197 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  38.27 
 
 
193 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  37.44 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  36.54 
 
 
214 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.76 
 
 
203 aa  119  3e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  36.92 
 
 
200 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  33.94 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  37.88 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  35.86 
 
 
204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  35.83 
 
 
197 aa  112  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  34.15 
 
 
212 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  35.94 
 
 
198 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.62 
 
 
201 aa  105  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  30.69 
 
 
202 aa  104  8e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  33.17 
 
 
208 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  36.06 
 
 
209 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  33.85 
 
 
204 aa  102  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  33.5 
 
 
200 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  33.51 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  34.21 
 
 
199 aa  99.8  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  34.03 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  32.5 
 
 
200 aa  98.2  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  31.63 
 
 
190 aa  91.7  7e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  30.61 
 
 
190 aa  91.7  7e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  31.63 
 
 
190 aa  91.3  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  29.84 
 
 
199 aa  89.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  38.39 
 
 
114 aa  81.6  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  31.03 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  36.94 
 
 
117 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  38.18 
 
 
118 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  34.48 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  35.14 
 
 
119 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  47.89 
 
 
74 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  46.03 
 
 
72 aa  65.1  0.0000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  31.48 
 
 
140 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  39.39 
 
 
71 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  41.67 
 
 
79 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2466  hypothetical protein  40.91 
 
 
69 aa  57.8  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315359  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  36.92 
 
 
76 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  43.48 
 
 
70 aa  52  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  31.88 
 
 
69 aa  52  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  38.81 
 
 
73 aa  51.6  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  35.29 
 
 
70 aa  51.6  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  35.29 
 
 
70 aa  50.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  39.13 
 
 
70 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  35.82 
 
 
68 aa  50.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  30.43 
 
 
75 aa  48.1  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  30.43 
 
 
75 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  42.03 
 
 
70 aa  47.8  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  36.23 
 
 
83 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  31.34 
 
 
72 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  34.38 
 
 
75 aa  47  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  28.99 
 
 
75 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  35.94 
 
 
76 aa  46.2  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  30.43 
 
 
75 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0027  SirA family protein  35.29 
 
 
70 aa  45.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.111426  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  30.43 
 
 
76 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  27.27 
 
 
76 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  24.64 
 
 
75 aa  45.1  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  30 
 
 
76 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  31.43 
 
 
75 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  28.57 
 
 
77 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  27.54 
 
 
75 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  31.51 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  25.76 
 
 
75 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  30.56 
 
 
80 aa  43.9  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  39.29 
 
 
69 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  26.09 
 
 
75 aa  43.9  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  28.57 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3246  SirA family protein  38.67 
 
 
73 aa  43.5  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  24.24 
 
 
75 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  29.58 
 
 
75 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  29.58 
 
 
76 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  24.64 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2434  rhodanese-like domain-containing protein  22.44 
 
 
356 aa  43.1  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.51 
 
 
189 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  30 
 
 
74 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  37.25 
 
 
75 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  31.51 
 
 
74 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  25.76 
 
 
76 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  37.25 
 
 
75 aa  43.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  31.51 
 
 
74 aa  43.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>