86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1678 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  370  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  98.95 
 
 
190 aa  369  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  97.89 
 
 
190 aa  365  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  66.15 
 
 
192 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  41.05 
 
 
199 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  40 
 
 
199 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  38.3 
 
 
200 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  39 
 
 
196 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  39.78 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  29.84 
 
 
193 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  30.26 
 
 
196 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  31.41 
 
 
190 aa  105  5e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  30.46 
 
 
199 aa  105  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  35.05 
 
 
195 aa  104  9e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  31.41 
 
 
190 aa  104  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  32.63 
 
 
193 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  28.87 
 
 
195 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.9 
 
 
199 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  30.3 
 
 
196 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  29.22 
 
 
223 aa  89.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  30.37 
 
 
203 aa  90.1  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  30.1 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  27.69 
 
 
195 aa  89  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  27.18 
 
 
195 aa  88.2  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  28.16 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  25 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  24.51 
 
 
202 aa  79.7  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  26.83 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  24.49 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  29.79 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  25.84 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  25 
 
 
200 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  29.94 
 
 
189 aa  77.4  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  25.94 
 
 
214 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  27.66 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  25.81 
 
 
197 aa  72.4  0.000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  25.74 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  24.75 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  21.29 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  24.74 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  26.74 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  33.33 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  33.33 
 
 
119 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  37.17 
 
 
118 aa  64.7  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  26.7 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  33.04 
 
 
114 aa  64.7  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  29.09 
 
 
117 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  24.64 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  37.31 
 
 
74 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  28.18 
 
 
140 aa  52  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  37.68 
 
 
79 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0248  hypothetical protein  33.9 
 
 
73 aa  45.4  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2421  SirA family protein  32.14 
 
 
84 aa  45.4  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  38.78 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.78 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  34.29 
 
 
73 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  36.17 
 
 
78 aa  44.7  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  35.29 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  38.3 
 
 
72 aa  44.7  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  35.29 
 
 
186 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  35.29 
 
 
186 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  50 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  32.65 
 
 
81 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  36.96 
 
 
76 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  33.33 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  36.96 
 
 
76 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  46.88 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  36.96 
 
 
76 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  46.88 
 
 
186 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  53.33 
 
 
75 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  36.96 
 
 
75 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  32.26 
 
 
213 aa  43.5  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  36.96 
 
 
76 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  33.33 
 
 
186 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  32.61 
 
 
201 aa  42.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  39.13 
 
 
76 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  31.91 
 
 
75 aa  42.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  36.96 
 
 
76 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.54 
 
 
78 aa  42.4  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2082  SirA family protein  25.37 
 
 
72 aa  42  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  50 
 
 
75 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  27.78 
 
 
78 aa  41.2  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  36.96 
 
 
75 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>