89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2500 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2500  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  374  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2206  hypothetical protein  99.47 
 
 		 190 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3077  SirA family protein  41.71 
 
 		 199 aa  178  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000237941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0124  SirA-like  42.93 
 
 		 193 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0144261  normal  0.614717 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1487  SirA family protein  40.72 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  38.46 
 
 		 195 aa  161  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0303  redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.44 
 
 		 199 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  38.78 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1887  SirA-like protein  44.9 
 
 		 195 aa  154  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3433  SirA family protein  37.76 
 
 		 195 aa  153  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000787487  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3495  SirA family protein  38.27 
 
 		 195 aa  152  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.70288e-33 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0367  SirA family protein  43.22 
 
 		 199 aa  151  7e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11340  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  37.06 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.544302  normal  0.497017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2448  SirA family protein  37.06 
 
 		 196 aa  147  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000888888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4588  SirA family protein  38.07 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.282378  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  38.07 
 
 		 196 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1688  SirA family protein  34.84 
 
 		 204 aa  140  8e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.733385  normal  0.789276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25450  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  36.73 
 
 		 201 aa  140  9e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.337434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3765  SirA family protein  37.31 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000718423  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0248  SirA family protein  37.75 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.322 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  36.71 
 
 		 211 aa  136  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3402  SirA family protein  37.63 
 
 		 200 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293629 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2159  SirA family protein  35.38 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1959  hypothetical protein  34.98 
 
 		 208 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.51951  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0677  hypothetical protein  37.11 
 
 		 197 aa  128  4.0000000000000003e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1888  hypothetical protein  36.45 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1060  hypothetical protein  33.66 
 
 		 206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1708  hypothetical protein  29 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0132248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1894  SirA family protein  34.45 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00825245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0368  hypothetical protein  28.23 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.162867 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  36.04 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1857  hypothetical protein  32.46 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0630  selenium metabolism protein YedF  34.95 
 
 		 198 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0025612  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1678  hypothetical protein  31.41 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1497  hypothetical protein  30.89 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1417  hypothetical protein  30.14 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.126908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0251  SirA family protein  28.92 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0830  hypothetical protein  39.64 
 
 		 114 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000290687 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1780  hypothetical protein  32.16 
 
 		 200 aa  99.8  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0463262  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2431  selenium metabolism protein YedF  35.9 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00446585  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0361  putative transcriptional regulator  32.64 
 
 		 192 aa  96.7  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  32.49 
 
 		 200 aa  95.1  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1779  hypothetical protein  32.84 
 
 		 199 aa  94.4  1e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0576  SirA-like protein  38.05 
 
 		 119 aa  89.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.676233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0573  SirA-like protein  36.75 
 
 		 119 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2893  SirA family protein  37.17 
 
 		 118 aa  89  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.455878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3421  hypothetical protein  37.5 
 
 		 140 aa  88.2  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00083332 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1581  hypothetical protein  34.78 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.052602 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0339  hypothetical protein  28.65 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.331374  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1620  SirA family protein  40 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.591727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2433  SirA family protein  37.14 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  23.53 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2088  hypothetical protein  46.43 
 
 		 69 aa  52.8  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  31.43 
 
 		 72 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0063  SirA family protein  31.88 
 
 		 69 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  30.1 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.27 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  33.87 
 
 		 76 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.14 
 
 		 75 aa  50.1  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.87 
 
 		 76 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.48 
 
 		 76 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  30.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  30.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0672  hypothetical protein  31.08 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00074605  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  38.24 
 
 		 76 aa  46.6  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  29.11 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  35.71 
 
 		 75 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  28.17 
 
 		 78 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4506  rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000693639 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0870  rhodanese domain protein  29.73 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000347313 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0686  hypothetical protein  29.73 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.745505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3169  SirA family protein  30.51 
 
 		 76 aa  45.8  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  32.26 
 
 		 75 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  32.26 
 
 		 76 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  36.54 
 
 		 75 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  27.85 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  28.38 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  28.38 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  37.5 
 
 		 70 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  24.64 
 
 		 78 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  35.38 
 
 		 80 aa  42  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  32.35 
 
 		 75 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00550  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  25.29 
 
 		 68 aa  41.6  0.008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  28.12 
 
 		 81 aa  41.6  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  25.71 
 
 		 102 aa  41.2  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>