74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1539 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  100 
 
 
92 aa  181  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  89.13 
 
 
92 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  88.04 
 
 
92 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  58.75 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  46.75 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  43.04 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  38.96 
 
 
80 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  50.68 
 
 
82 aa  68.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  43.06 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  43.42 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  35.06 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  48.61 
 
 
87 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  44 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  37.08 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  42.86 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  33.75 
 
 
89 aa  60.5  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  36.49 
 
 
74 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  40.51 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  40.68 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  39.47 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  37.66 
 
 
85 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  34.09 
 
 
85 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  37.5 
 
 
796 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  36.67 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  31.08 
 
 
77 aa  50.4  0.000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  37.7 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  37.7 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  31.25 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  31.71 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  42.68 
 
 
196 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  29.87 
 
 
80 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  34.72 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  37.93 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  45.71 
 
 
195 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  29.63 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  31.94 
 
 
70 aa  44.7  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  29.63 
 
 
82 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  33.9 
 
 
75 aa  44.7  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  37.74 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  31.51 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  40.82 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  31.94 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  32.14 
 
 
77 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1696  SirA family protein  38.46 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  30.56 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  30.56 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.58 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  41.82 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  38.98 
 
 
78 aa  42  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  42.59 
 
 
81 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  26.92 
 
 
82 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  35 
 
 
76 aa  41.6  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1650  SirA family protein  30.36 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  40 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2436  SirA family protein  39.22 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512226 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2346  SirA family protein  30.36 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.416048  decreased coverage  0.000000000487815 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  27.27 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  34.92 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  34.92 
 
 
76 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  29.49 
 
 
201 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  36.84 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2136  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 
200 aa  40.4  0.009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>