234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19740 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  178  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  83.6  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  49.33 
 
 		 78 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  46.05 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  44.74 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  44 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  40.51 
 
 		 89 aa  78.2  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  40.79 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  42.31 
 
 		 78 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  39.47 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  39.47 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  45 
 
 		 82 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  42.42 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  43.08 
 
 		 75 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  49.06 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  36.23 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  36.23 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  33.33 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  35.06 
 
 		 201 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  41.38 
 
 		 82 aa  53.5  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  33.33 
 
 		 73 aa  52.4  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  41.82 
 
 		 82 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  35.82 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  42.37 
 
 		 75 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  36.76 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  33.8 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  26.47 
 
 		 75 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  35.14 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  38.24 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  35.94 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  38.24 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  35.21 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  35.14 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  32.35 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  25.68 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  30.56 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  33.85 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  32.43 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  38.24 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  40.3 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  33.78 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  28.38 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  36.49 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  30.67 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  32.88 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  33.33 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  26.92 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  33.8 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  28.4 
 
 		 194 aa  47  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  32.43 
 
 		 78 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  35.82 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  35.14 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  35.59 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  30.88 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  37.33 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  30.88 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.5 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  33.85 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  35.19 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  24.32 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  32.43 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  35.19 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  35.19 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>