64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2416 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2416  SirA family protein  100 
 
 
92 aa  179  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2328  SirA family protein  98.91 
 
 
92 aa  176  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.471401  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1539  SirA-like protein  88.04 
 
 
92 aa  159  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109723  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2274  SirA-like protein  69.74 
 
 
88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.942558  normal  0.0817035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2542  SirA-like protein  46.15 
 
 
81 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000362525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4106  SirA family protein  40.28 
 
 
80 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.185078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  44.74 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3765  hypothetical protein  44.87 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1771  SirA family protein  50 
 
 
87 aa  68.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0507486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3940  redox protein regulator of disulfide bond formation-like protein  41.67 
 
 
74 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00180546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0648  SirA family protein  45.57 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.900816  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1189  SirA family protein  35.53 
 
 
81 aa  63.9  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3190  SirA family protein  44.07 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2929  SirA family protein  44.07 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1977  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.73492  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2243  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  39.19 
 
 
77 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1571  hypothetical protein  37.84 
 
 
74 aa  61.2  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000229644  normal  0.442778 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4691  hypothetical protein  39.24 
 
 
84 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.511944  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1752  SirA-like  35.8 
 
 
89 aa  60.1  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2099  SirA family protein  39.74 
 
 
80 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.837047 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2075  hypothetical protein  43.28 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1352  hypothetical protein  35.14 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1981  SirA family protein  38.46 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0380  SirA-like  37.5 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3413  hypothetical protein  46.3 
 
 
77 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1094  Ferredoxin--nitrite reductase  42 
 
 
796 aa  53.9  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268202  normal  0.0850268 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0559  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.50687 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  32.88 
 
 
85 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  36.21 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  32.43 
 
 
80 aa  47  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  31.25 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  34.72 
 
 
70 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  34.72 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0025  hypothetical protein  34.43 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00221  hypothetical protein  44.44 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  33.33 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  31.71 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  31.94 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  31.51 
 
 
73 aa  44.7  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00171  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.187807  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00171  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  31.71 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0018  hypothetical protein  40.82 
 
 
76 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.722623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  38.6 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  37.5 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4184  SirA family protein  38.1 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.842151  normal  0.584926 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  37.5 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  39.62 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1085  hypothetical protein  41.46 
 
 
196 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  5.60528e-18  hitchhiker  0.0000092747 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  31.94 
 
 
76 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2521  hypothetical protein  44.29 
 
 
195 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.104075  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0021  hypothetical protein  35.19 
 
 
76 aa  42  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  25 
 
 
75 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  31.94 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2868  hypothetical protein  30.36 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  23.68 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  39.29 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>