66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1822 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1822  redox protein, regulator of disulfide bond formation  100 
 
 
75 aa  156  1e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  67.14 
 
 
74 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  67.14 
 
 
74 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1499  hypothetical protein  65.28 
 
 
74 aa  103  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  58.11 
 
 
75 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  58.11 
 
 
76 aa  97.4  5e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  58.11 
 
 
76 aa  97.1  7e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  56.76 
 
 
75 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  55.41 
 
 
75 aa  94.7  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22790  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  56.76 
 
 
75 aa  90.5  7e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  49.32 
 
 
73 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  34.67 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0718  SirA family protein  36.23 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.78 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  30.43 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0447  SirA-like  28.38 
 
 
74 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  29.41 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  29.41 
 
 
79 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2572  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  35.94 
 
 
834 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0240201  hitchhiker  0.00088706 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  28.17 
 
 
70 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  28.17 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  35 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  43.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.2 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.51 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  31.88 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  30.99 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0330  SirA family protein  32.89 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.2 
 
 
76 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  30.91 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  31.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  33.87 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  31.51 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  28.17 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  32.79 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  30 
 
 
77 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  30.43 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  28.57 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  30.43 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  26.76 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1262  SirA family protein  40.91 
 
 
116 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  31.67 
 
 
77 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>