275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0643 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  100 
 
 
70 aa  143  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  92.86 
 
 
70 aa  135  1e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  90 
 
 
70 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1319  SirA family protein  78.57 
 
 
70 aa  116  9e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.514232  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0855  SirA family protein  70 
 
 
70 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.412959  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3934  SirA family protein  44.26 
 
 
82 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.125725  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3921  SirA family protein  42.86 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  39.71 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  44.12 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  38.57 
 
 
77 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  44.12 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  36.23 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  36.23 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  36.23 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  39.13 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  35.82 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  36.76 
 
 
78 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  35.29 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  33.82 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  35.29 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  34.78 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  31.88 
 
 
76 aa  52.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.14 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  36.23 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  32.35 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  42.65 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  34.29 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  35.71 
 
 
77 aa  52.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  42.65 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  38.57 
 
 
189 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0669  SirA family protein  36.76 
 
 
78 aa  52.8  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1694  SirA family protein  37.31 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4059  hypothetical protein  38.24 
 
 
90 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  33.82 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  42.65 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  35.82 
 
 
74 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  39.66 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  40.58 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  33.33 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2500  SirA family protein  34.29 
 
 
213 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1628  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.241969 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  34.78 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  38.57 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.33 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  31.88 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01915  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  40 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0686  SirA family protein  34.29 
 
 
194 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01901  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2303  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2945  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.91003  hitchhiker  0.00000000000335476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  40.58 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1220  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.466451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1048  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.609594  normal  0.0924415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2150  hypothetical protein  34.78 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  32.35 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  32.35 
 
 
76 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1645  SirA family protein  34.78 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1210  SirA family protein  39.13 
 
 
75 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  32.86 
 
 
78 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  32.86 
 
 
186 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1242  SirA family protein  39.13 
 
 
196 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  30.88 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  33.82 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1439  SirA-like  36.76 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145745  normal  0.024487 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  37.68 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  37.1 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0807  selenium metabolism protein YedF  40 
 
 
211 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.45173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  36.23 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2054  selenium metabolism protein YedF  47.17 
 
 
196 aa  49.7  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  33.82 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  33.33 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.71 
 
 
189 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  39.13 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  39.71 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  37.14 
 
 
91 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  38.24 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  31.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  35.71 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  35.29 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2081  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0079924  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  35.71 
 
 
186 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2118  hypothetical protein  32.86 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.263251  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  31.88 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  33.93 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  36.76 
 
 
181 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  32.86 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  32.86 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  33.82 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  37.7 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>