107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1674 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  153  8e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  153  8e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  96 
 
 
75 aa  149  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  81.33 
 
 
75 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  71.62 
 
 
78 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  68.57 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  68.57 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  68.57 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  67.14 
 
 
77 aa  107  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  67.14 
 
 
77 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  67.14 
 
 
77 aa  107  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  67.14 
 
 
77 aa  107  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  67.14 
 
 
77 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  64.29 
 
 
79 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  64.29 
 
 
77 aa  103  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  62.86 
 
 
89 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  62.86 
 
 
89 aa  102  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  62.86 
 
 
89 aa  102  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  62.86 
 
 
77 aa  102  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  57.14 
 
 
78 aa  93.6  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  53.52 
 
 
81 aa  92  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  51.35 
 
 
82 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  51.35 
 
 
82 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  39.47 
 
 
88 aa  73.9  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  46.67 
 
 
78 aa  65.5  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  45.45 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  45.45 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  43.66 
 
 
76 aa  60.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  33.78 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  35 
 
 
73 aa  50.8  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  32.26 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  32.43 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0064  SirA family protein  35.71 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.87 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  35.21 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  38.1 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  31.51 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  33.78 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  31.94 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  29.41 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  31.08 
 
 
76 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3129  SirA-like  37.68 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  32.43 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  33.82 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  35.14 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  35.29 
 
 
75 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  39.66 
 
 
82 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  29.73 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  29.73 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  29.73 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  36.23 
 
 
181 aa  46.2  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  35.21 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  29.73 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  28.38 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  28.38 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0054  hypothetical protein  29.73 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  32.35 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3688  SirA-like  36.62 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  35.21 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  31.08 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  31.08 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0975  SirA-like protein  38.24 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.369067  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  35.21 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2937  SirA-like  38.24 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0978  SirA family protein  36.62 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0114244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0863  SirA family protein  35.21 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.252783  normal  0.310522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  32.35 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3493  SirA-like  33.8 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.73146  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  36.76 
 
 
89 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0831  SirA family protein  35.29 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.378872  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  30.88 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0059  SirA-like  28.38 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.470716 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  23.88 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  42.55 
 
 
325 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.04 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  30.77 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1138  SirA family protein  30.14 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0574042  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  30.99 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0858  SirA family protein  33.9 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  27.4 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  30.88 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  29.85 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  28.57 
 
 
73 aa  41.2  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  28 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  29.85 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  28.38 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  34.78 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  28.38 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>